FlowJo 10是一款非常不錯的流式細(xì)胞數(shù)據(jù)分析軟件,擁有非常強大的數(shù)據(jù)處理和分析功能,通過圖像分析細(xì)胞的各種變化,結(jié)合細(xì)胞模型創(chuàng)建合理的數(shù)據(jù)分析平臺,支持參數(shù)導(dǎo)出功能,可以兼容幾乎所有流式儀器采集的數(shù)據(jù),幫助用戶輕松了解了解細(xì)胞的狀態(tài)變化!
軟件特色
1、階梯式設(shè)門
FlowJo獨特的階梯式設(shè)門試一次革命性的創(chuàng)新。他一改傳統(tǒng)復(fù)雜的邏輯門設(shè)置,將細(xì)胞群之間的邏輯關(guān)系用簡單的遞進(jìn)階梯式去呈現(xiàn),并可以自定義細(xì)胞群名稱、進(jìn)而直觀的現(xiàn)實細(xì)胞群統(tǒng)計值,讓分析結(jié)果一目了然,簡單清晰。
2、圖像呈現(xiàn)法
①多維參數(shù)顯示
FlowJo提供了靈活的數(shù)據(jù)呈現(xiàn)方式,全方位滿足用戶的數(shù)據(jù)分析需要。它可以呈現(xiàn)一維的直方圖,傳統(tǒng)的二維圖形,及動態(tài)立體的三維圖形,從多個角度和空間對數(shù)據(jù)進(jìn)行360°的靜態(tài)以及動態(tài)解析。
②多種圖形類型
FlowJo除了提供傳統(tǒng)的散點圖,還提供多種圖形類型(如密度圖,等高圖,偽色圖,斑馬圖等),在滿足不同分析需求的同時還保證了圖像的美觀和科學(xué)嚴(yán)謹(jǐn)需求。
3、多種設(shè)門工具
設(shè)門是流失數(shù)據(jù)分析中界定細(xì)胞目標(biāo)群的必要手段,不管要檢測的目標(biāo)細(xì)胞群是規(guī)則分布還是不規(guī)則分布,小概率事件還是大概率事件,F(xiàn)lowJo提供了多種設(shè)門工具,從而讓用戶方便的界定各種細(xì)胞群。
4、強大的批量處理功能
用戶可以做一個樣品的門分析,然后將這個分析批處理應(yīng)用到其他樣品上;也可以做一個樣品的圖形分析,然后將這個分析批處理用到其他樣品上。這樣避免了對每一個樣品進(jìn)行重復(fù)性試驗的分析,即保證了數(shù)據(jù)分析的一致性及靈活性,同時也極大地提高了分析的效率并且得到完美的分析結(jié)果。
①門的批處理
你可以將一個樣品的門分析,批量應(yīng)用到其他的樣品上。整個過程只需要輕輕拖動鼠標(biāo)就可完成,非常簡單。
②圖形分析的批處理
圖像處理也可以用批量分析的方法,將一個樣品的分析應(yīng)用到其他樣品上。
5、多種分析平臺及工具
FlowJo自身包含了多個特殊的分析平臺來滿足細(xì)胞周期,細(xì)胞增殖,動力學(xué)(鈣離子流量)等的分析。這些平臺采用權(quán)威的已發(fā)表的模型算法原理設(shè)計,來精確模擬數(shù)據(jù)分布。FlowJo還包含了多種獨特的分析工具,如數(shù)據(jù)聯(lián)結(jié)、衍生參數(shù)軸、校準(zhǔn)、Backgating、Show Ancestry、Sample Comparision等,讓你對數(shù)據(jù)作進(jìn)一步的深層分析及處理。
6、熒光補償
熒光補償是六十分析里面一個重要的概念也是一個復(fù)雜的過程,卻是流式分析必不可缺的部分。軟件補償一改過去在機器上手動調(diào)節(jié)補償?shù)娜唛L復(fù)雜過程,大大簡化了熒光補償過程,將補償數(shù)據(jù)的過程變成一個可理解,可見的簡單過程,同時提供了在機器上手動補償所沒有的精確度和靈活性。
7、靈活方便的數(shù)據(jù)導(dǎo)出
數(shù)據(jù)的導(dǎo)出在FlowJo里面非常的輕松方便。不管是圖形數(shù)據(jù)還是數(shù)據(jù)表格,都可以方便的導(dǎo)出成各種格式用來做數(shù)據(jù)的分享和發(fā)表。
軟件功能
1、反向控制分析
一旦你的分析包含了門內(nèi)門控產(chǎn)生的亞群,就可以看到一個給定亞群的源圖形。反向控制分析顯示在每個階段的圖突出最后亞群的每個門控操作圖。
2、抗體面板向?qū)?/p>
這個逐步的工具包含了許多供應(yīng)商的抗體目錄和你的流式細(xì)胞儀的配置,使抗體面板設(shè)計更精簡的過程。它有一個在線網(wǎng)站,fluorish.com,在那里你可以與你的核心或?qū)嶒炇医?jīng)理或同事聯(lián)系,得到儀器的配置,搜索組抗體,抗體和購買。
3、細(xì)胞周期分析
軟件有一個細(xì)胞周期的平臺,采用多種模型對數(shù)據(jù)進(jìn)行擬合,擬合參數(shù)的約束,并自動計算在G1期,細(xì)胞的百分比,或G2期。所有的模型都可以復(fù)制到其他的人群或樣本中,使用相同的簡單的拖放界面來傳播其他的門或分析。
4、補償
污漬的光譜重疊處理補償工具在軟件。計算補償矩陣的接口是基于單染色控制樣本的集合。然后您可以將這個補償矩陣應(yīng)用到多染色的樣本中。軟件增加了補償參數(shù)多染色樣品,這樣你就可以查看和分析補償數(shù)據(jù)。
5、導(dǎo)出參數(shù)
軟件讓你定義為樣本的新參數(shù)。這些可能包括縮放參數(shù)(擴展感興趣區(qū)域),時間參數(shù)(用于執(zhí)行動力學(xué)分析),比率參數(shù),或在log和線性縮放之間轉(zhuǎn)換的參數(shù)。派生參數(shù)定義可以復(fù)制到整個組的樣本中。
6、FCS掃描
FCS掃描工具將掃描本地或遠(yuǎn)程文件系統(tǒng)的FCS文件。當(dāng)你想找到符合特定條件的FCS文件(污點協(xié)議、操作員ID、運行日期、機器等),或者當(dāng)FCS文件被移動并需要重新定位時,這個實用工具就很方便了。
7、影視
分析平臺獨特的軟件:查看你的數(shù)據(jù)動態(tài)。使用圖形窗口或布局編輯器電影來生成圖形作為時間的函數(shù)(動能分析),或者生成一個或兩個參數(shù)作為第三的函數(shù)的圖。這種獨特的可視化可以讓您發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)中的微妙關(guān)系,否則將不可能看到其他的關(guān)系。
8、板編輯
一個全新的平臺進(jìn)行注釋,分組和組織板基于流式細(xì)胞儀檢測數(shù)據(jù)的元數(shù)據(jù)注釋工具板,進(jìn)口板材快速標(biāo)注一個CSV文件,并能夠設(shè)置標(biāo)注滴定。
使用教程
如果你對不同的病人做相似的實驗,你可以保存一個工作區(qū)作為一個模板,包含所有的門、統(tǒng)計數(shù)據(jù)、表格和布局。下周,當(dāng)你和不同的病人做同樣的實驗時,大部分工作已經(jīng)為你做完了!您只需將新的示例導(dǎo)入模板工作區(qū)即可。良好的模板設(shè)計節(jié)省了大量的軟件分析時間和標(biāo)準(zhǔn)化報表。
1、將樣本加載到工作區(qū)中。
2、為相關(guān)的示例、門等創(chuàng)建組。
3、詳細(xì)分析單個示例,創(chuàng)建門戶、統(tǒng)計數(shù)據(jù)等。
4、對組中的所有樣本應(yīng)用適當(dāng)?shù)姆治觥?/p>
5、檢查組中樣品的澆口:易于修改樣品以適應(yīng)樣品變化。
6、生成一個圖形布局,您可以在其中顯示所有示例中的特定圖形。
7、生成一個表,您可以在其中創(chuàng)建所有樣本的特定統(tǒng)計信息。
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